Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afvQ3THW5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afvQ3THW5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms