Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms