Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riiad1Q3KNY5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms