Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN7

Defb26, Beta-defensin, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb26Q30KN7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Defb26Q30KN7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb26Q30KN7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb26Q30KN7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb26Q30KN7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Defb26Q30KN7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb26Q30KN7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb26Q30KN7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb26Q30KN7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb26Q30KN7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb26Q30KN7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb26Q30KN7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb26Q30KN7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms