Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pi4k2aQ2TBE6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4k2aQ2TBE6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms