Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna5Q2MKA5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna5Q2MKA5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms