Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd3Q14AI6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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