Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VgfQ0VGU4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VgfQ0VGU4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VgfQ0VGU4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms