Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b3Q0VF55 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms