Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmntd2Q0VET5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmntd2Q0VET5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms