Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hif3aQ0VBL6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hif3aQ0VBL6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms