Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r181Q0P547 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms