Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kndc1Q0KK55 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kndc1Q0KK55 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kndc1Q0KK55 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms