Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnnm1Q0GA42 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms