Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcnt1Q09324 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcnt1Q09324 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms