Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700061G19RikQ08EE8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms