Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms