Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc4Q08624 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc4Q08624 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc4Q08624 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc4Q08624 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc4Q08624 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc4Q08624 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc4Q08624 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc4Q08624 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc4Q08624 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc4Q08624 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc4Q08624 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc4Q08624 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc4Q08624 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc4Q08624 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc4Q08624 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc4Q08624 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc4Q08624 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc4Q08624 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc4Q08624 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc4Q08624 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc4Q08624 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc4Q08624 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc4Q08624 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc4Q08624 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms