Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Calb2Q08331 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms