Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms