Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp2Q06649 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms