Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf4Q06507 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms