Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox13Q04891 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms