Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms