Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tff2Q03404 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms