Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msx2Q03358 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms