Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna1sQ02789 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms