Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sec23aQ01405 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms