Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EgfrQ01279 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EgfrQ01279 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms