Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rbp1Q00915 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms