Protein–RNA interactions for Protein: Q00898

Serpina1e, Alpha-1-antitrypsin 1-5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1eQ00898 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Serpina1eQ00898 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serpina1eQ00898 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms