Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Serpina1cQ00896 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Serpina1cQ00896 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serpina1cQ00896 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms