Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cds1P98191 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cds1P98191 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cds1P98191 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cds1P98191 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cds1P98191 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cds1P98191 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cds1P98191 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms