Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc1P98083 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Shc1P98083 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc1P98083 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc1P98083 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc1P98083 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shc1P98083 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms