Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfdP97946 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfdP97946 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfdP97946 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfdP97946 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfdP97946 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfdP97946 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfdP97946 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfdP97946 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms