Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rbbp6P97868 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp6P97868 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms