Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcc1P97496 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarcc1P97496 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms