Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx2P97474 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms