Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas1P97459 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas1P97459 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas1P97459 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas1P97459 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas1P97459 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms