Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig3P97386 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig3P97386 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig3P97386 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig3P97386 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig3P97386 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig3P97386 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms