Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis3P97368 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis3P97368 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis3P97368 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis3P97368 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis3P97368 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms