Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhodP97348 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhodP97348 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhodP97348 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhodP97348 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhodP97348 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhodP97348 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhodP97348 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhodP97348 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhodP97348 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhodP97348 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhodP97348 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhodP97348 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhodP97348 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhodP97348 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhodP97348 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhodP97348 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhodP97348 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhodP97348 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhodP97348 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhodP97348 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhodP97348 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhodP97348 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhodP97348 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhodP97348 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhodP97348 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RhodP97348 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhodP97348 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhodP97348 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhodP97348 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhodP97348 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhodP97348 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhodP97348 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhodP97348 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RhodP97348 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhodP97348 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhodP97348 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhodP97348 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhodP97348 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhodP97348 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhodP97348 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhodP97348 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhodP97348 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhodP97348 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhodP97348 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhodP97348 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhodP97348 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhodP97348 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhodP97348 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhodP97348 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhodP97348 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhodP97348 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhodP97348 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RhodP97348 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhodP97348 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhodP97348 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhodP97348 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhodP97348 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhodP97348 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhodP97348 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhodP97348 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhodP97348 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhodP97348 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhodP97348 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhodP97348 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhodP97348 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhodP97348 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhodP97348 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RhodP97348 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms