Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mesp1P97309 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms