Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H3f3aP84244 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3f3aP84244 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H3f3aP84244 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms