Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx1P83917 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms