Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubg1P83887 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms