Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NyxP83503 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NyxP83503 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NyxP83503 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NyxP83503 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NyxP83503 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NyxP83503 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NyxP83503 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NyxP83503 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NyxP83503 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NyxP83503 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NyxP83503 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NyxP83503 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NyxP83503 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NyxP83503 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NyxP83503 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NyxP83503 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NyxP83503 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NyxP83503 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NyxP83503 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NyxP83503 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NyxP83503 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NyxP83503 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NyxP83503 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NyxP83503 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NyxP83503 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NyxP83503 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NyxP83503 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NyxP83503 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NyxP83503 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NyxP83503 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NyxP83503 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NyxP83503 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NyxP83503 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NyxP83503 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NyxP83503 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NyxP83503 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NyxP83503 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NyxP83503 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NyxP83503 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NyxP83503 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NyxP83503 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NyxP83503 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NyxP83503 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NyxP83503 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NyxP83503 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NyxP83503 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NyxP83503 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NyxP83503 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NyxP83503 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NyxP83503 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NyxP83503 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NyxP83503 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NyxP83503 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NyxP83503 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NyxP83503 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NyxP83503 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NyxP83503 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NyxP83503 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NyxP83503 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NyxP83503 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NyxP83503 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NyxP83503 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NyxP83503 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NyxP83503 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NyxP83503 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NyxP83503 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NyxP83503 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NyxP83503 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NyxP83503 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NyxP83503 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NyxP83503 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NyxP83503 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NyxP83503 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NyxP83503 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NyxP83503 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NyxP83503 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NyxP83503 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NyxP83503 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NyxP83503 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NyxP83503 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NyxP83503 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NyxP83503 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NyxP83503 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NyxP83503 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NyxP83503 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NyxP83503 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NyxP83503 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NyxP83503 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NyxP83503 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NyxP83503 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NyxP83503 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NyxP83503 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NyxP83503 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NyxP83503 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NyxP83503 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NyxP83503 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NyxP83503 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NyxP83503 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NyxP83503 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms