Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx2P81066 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx2P81066 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx2P81066 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx2P81066 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx2P81066 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx2P81066 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx2P81066 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx2P81066 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx2P81066 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms