Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct7P80313 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct7P80313 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct7P80313 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct7P80313 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct7P80313 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Cct7P80313 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cct7P80313 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct7P80313 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct7P80313 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct7P80313 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct7P80313 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct7P80313 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct7P80313 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct7P80313 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms