Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx2P80206 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx2P80206 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx2P80206 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx2P80206 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx2P80206 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx2P80206 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Otx2P80206 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx2P80206 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms